Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lima1Q9ERG0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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