Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clstn2Q9ER65 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms