Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfrsf23Q9ER63 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms