Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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