Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Swt1Q9DBQ9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swt1Q9DBQ9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms