Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc89Q9DA73 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc89Q9DA73 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc89Q9DA73 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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