Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ribc2Q9D4Q1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ribc2Q9D4Q1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms