Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms