Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcc1Q9D4H2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms