Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cfap53Q9D439 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfap53Q9D439 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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