Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spns3Q9D232 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms