Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ribc1Q9D0B8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ribc1Q9D0B8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms