Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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