Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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