Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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