Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snw1Q9CSN1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snw1Q9CSN1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms