Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms