Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccer1Q9CQL2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccer1Q9CQL2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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