Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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