Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims1Q99NE5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms