Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc5Q99LG4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc5Q99LG4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc5Q99LG4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc5Q99LG4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc5Q99LG4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ttc5Q99LG4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc5Q99LG4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms