Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ctu1Q99J10 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctu1Q99J10 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ctu1Q99J10 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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