Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim59Q922Y2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms