Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms