Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc115Q8VE99 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc115Q8VE99 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc115Q8VE99 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms