Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RfxapQ8VCG9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms