Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms