Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobrQ8VBT6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms