Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc12Q8R344 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms