Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r188Q8K3N2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms