Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2D3

Edc3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc3Q8K2D3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Edc3Q8K2D3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms