Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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