Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgcll1Q8JZS7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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