Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Upp2Q8CGR7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms