Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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