Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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