Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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