Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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