Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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