Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FarsaQ8C0C7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms