Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Fam53cQ8BXQ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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