Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops7bQ8BV13 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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