Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms