Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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