Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms