Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms