Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms