Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx13Q6PHS6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx13Q6PHS6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms