Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim37Q6PCX9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim37Q6PCX9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim37Q6PCX9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim37Q6PCX9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Trim37Q6PCX9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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