Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms